python+tifffile之tiff文件读写方式_Python

python+tifffile之tiff文件读写方式

2020-04-26 09:39yuanlulu Python

今天小编就为大家分享一篇python+tifffile之tiff文件读写方式，具有很好的参考价值，希望对大家有所帮助。一起跟随小编过来看看吧

背景

使用python操作一批同样分辨率的图片，合并为tiff格式的文件。

由于opencv主要用于读取单帧的tiff文件，对多帧的文件支持并不好。

通过搜索发现了两个比较有用的包：TiffCapture和tifffile。两者都可用pip安装。

其中前者主要用于读取tiff文件，后者可读可写。最终选择tifffile来合成tiff图片文件。

安装tifffile

				?

									pip install tifffile

原理及代码

我的图片是8 bit灰度图。

每次读取之后，先升维：

				?

									new_gray = gray_img[np.newaxis, ::]

然后再使用np.append添加到数组里。每append一次，相当于tiff增加一帧图片。

				?

									tiff_list = np.append(tiff_list, new_gray, axis=0)

所有操作完毕，则一次性保存到磁盘。

				?

									tifffile.imsave( out_tiff_path, tiff_list )

下面是我的完整代码：

				?

									import cv2

									import tifffile

									import time

									import numpy as np

									import time

									import os

									img_path = '../word_all'

									out_txt_path = '../out_word_all.box'

									out_tiff_path = '../out_word_all.tif'

									tiff_list = None

									with open(out_txt_path, 'wb') as f:

									  dir_list = os.listdir(img_path)

									  cnt_num = 0

									  for dir_name in dir_list:

									    dir_path = os.path.join(img_path, dir_name)

									    img_list = os.listdir(dir_path)

									    pwd = os.getcwd()

									    os.chdir(dir_path)

									    for img in img_list:

									      print('dir_path:{}'.format(dir_path))

									      gray_img = cv2.imread(img, cv2.IMREAD_GRAYSCALE)

									      new_gray = gray_img[np.newaxis, ::]

									      print('gray_img shape:{}, new_gray shape:{}'.format(gray_img.shape, new_gray.shape))

									      #global cnt_num

									      if cnt_num == 0:

									        print('cnt_num == 0')

									        tiff_list = new_gray

									      else:

									        print('np.append')

									        tiff_list = np.append(tiff_list, new_gray, axis=0)

									        print('tiff_list shape:{}'.format(tiff_list.shape))

									      content = '{} 2 2 60 60 {}\n'.format(dir_name, cnt_num)

									      print(content)

									      f.write(content.encode('UTF-8'))

									      cnt_num += 1

									    os.chdir(pwd)

									  tifffile.imsave( out_tiff_path, tiff_list )

									print('tiff_list shape:{}'.format(tiff_list.shape))