python 将dicom图片转换成jpg图片的实例_Python

python 将dicom图片转换成jpg图片的实例

2020-04-25 14:16GoHowz Python

今天小编就为大家分享一篇python 将dicom图片转换成jpg图片的实例，具有很好的参考价值，希望对大家有所帮助。一起跟随小编过来看看吧

主要原理：调整dicom的窗宽，使之各个像素点上的灰度值缩放至[0,255]范围内。

使用到的python库：SimpleITK

下面是一个将dicom（.dcm）图片转换成jpg图片的demo：

				?

									import SimpleITK as sitk

									import numpy as np

									import cv2

									def convert_from_dicom_to_jpg(img,low_window,high_window,save_path):

									  lungwin = np.array([low_window*1.,high_window*1.])

									  newimg = (img-lungwin[0])/(lungwin[1]-lungwin[0])  #归一化

									  newimg = (newimg*255).astype('uint8')        #将像素值扩展到[0,255]

									  cv2.imwrite(save_path, newimg, [int(cv2.IMWRITE_JPEG_QUALITY), 100])

									if __name__ == '__main__':

									  # 下面是将对应的dicom格式的图片转成jpg

									  dcm_image_path = '/DICOM_image/lung001.dcm'    #读取dicom文件

									  output_jpg_path = 'JPG_image/lung001.jpg'

									  ds_array = sitk.ReadImage(dcm_image_path)     #读取dicom文件的相关信息

									  img_array = sitk.GetArrayFromImage(ds_array)   #获取array

									  # SimpleITK读取的图像数据的坐标顺序为zyx，即从多少张切片到单张切片的宽和高，此处我们读取单张，因此img_array的shape

									  #类似于 （1，height，width）的形式

									  shape = img_array.shape

									  img_array = np.reshape(img_array, (shape[1], shape[2])) #获取array中的height和width

									  high = np.max(img_array)

									  low = np.min(img_array)

									  convert_from_dicom_to_jpg(img_array, low, high, output_jpg_path)  #调用函数，转换成jpg文件并保存到对应的路径

									  print('FINISHED')