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计算 Python 代码的内存和模型显存消耗的小技巧

2021-12-21 00:46deephub Python

了解Python代码的内存消耗是每一个开发人员都必须要解决的问题,这个问题不仅在我们使用pandas读取和处理CSV文件的时候非常重要,在我们使用GPU训练的时候还需要规划GPU的内存使用。尤其是我们在白嫖使用kaggle和colab时显得更为重

本篇文章我们将介绍两个 Python 库 memory_profiler和Pytorch-Memory-Utils这两个库可以帮助我们了解内存和显存的消耗。

计算 Python 代码的内存和模型显存消耗的小技巧

memory_profiler

  1. pip install memory_profiler#Load its magic function 
  2. %load_ext memory_profiler 
  3. from memory_profiler import profile 

memory_profiler可以完成以下的工作:

1、查找一行的内存消耗

我们只需要在代码的前面加上魔法函数 %memit

  1. %memit x = 10+5 
  2. #Output 
  3. peak memory: 54.01 MiB, increment: 0.27 MiB 

这里,峰值内存(peak memory)是运行此代码的进程消耗的内存。增量只是由于添加这行代码而需要/消耗的内存。同样的逻辑也适用于以下其他的显示。

2、查找函数的内存消耗

在调用函数的行的开头添加魔法函数。

  1. def addition(): 
  2.     a = [1] * (10 ** 1) 
  3.     b = [2] * (3 * 10 ** 2) 
  4.     sum = a+b 
  5.     return sum 
  6.  
  7. %memit addition() 
  8. #Output 
  9. peak memory: 36.36 MiB, increment: 0.01 MiB 

3、逐行查找函数的内存消耗

如果需要记录函数中每一行的内存使用,我们可以使用@profile 装饰器。 但是@profile 仅适用于在单独模块中定义的函数,因此我们将首先使用 %%file 创建一个名为 demo.py 的简单模块,其中包含我们的函数

  1. %%file demo.py 
  2. from memory_profiler import profile 
  3.  
  4. @profile 
  5. def addition(): 
  6.     a = [1] * (10 ** 1) 
  7.     b = [2] * (3 * 10 ** 2) 
  8.     sum = a+b 
  9.     return sum 

现在,我们可以调用该函数

  1. from demo import addition 
  2.  
  3. %memit addition() 
  4.  
  5. #Output 
  6. Line #    Mem usage    Increment   Line Contents 
  7. ================================================ 
  8.      2     36.4 MiB     36.4 MiB   @profile 
  9.      3                             def addition(): 
  10.      4     36.4 MiB      0.0 MiB       a = [1] * (10 ** 1) 
  11.      5   3851.1 MiB   3814.7 MiB       b = [2] * (3 * 10 ** 2) 
  12.      6   7665.9 MiB   3814.8 MiB       sum = a+b 
  13.      7   7665.9 MiB      0.0 MiB       return sum 
  14. peak memory: 7665.88 MiB, increment: 7629.52 MiB 

4、完整python脚本的内存消耗

这个这个方法不能再 notebook 中使用。我们必须创建 python 脚本并通过命令行运行它。

  1. #create script.py 
  2. import time 
  3.  
  4. @profile 
  5. def function1(): 
  6.     n = 100000 
  7.     a = [1] * n 
  8.     time.sleep(1) 
  9.     return a 
  10.      
  11. @profile 
  12. def function2(): 
  13.     n = 200000 
  14.     b = [1] * n 
  15.     time.sleep(1) 
  16.     return b 
  17.  
  18. if __name__ == "__main__"
  19.     function1() 
  20.     function2() 

之后运行脚本并查看

  1. #On command line 
  2. mprof run script.py 
  3. #To generate plot  
  4. mprof plot 

我们可以看到内存消耗与时间的关系图

计算 Python 代码的内存和模型显存消耗的小技巧

@profile装饰器没有必要放在函数前面,如果我们不保留它,我们不会看到函数级内存消耗,但我们会看到整个脚本的内存消耗

计算 Python 代码的内存和模型显存消耗的小技巧

Pytorch-Memory-Utils

通过Pytorch-Memory-Utils工具,我们在使用显存的代码中间插入检测函数,这样就可以输出在当前行代码时所占用的显存。这个对于我们计算模型的GPU显存占用是非常方便的,通过计算显存占用,我们才能够最大化训练的batch size,保证训练的最优速度。

  1. import torch 
  2. import inspect 
  3.  
  4. from torchvision import models 
  5. from gpu_mem_track import MemTracker  # 引用显存跟踪代码 
  6.  
  7. device = torch.device('cuda:0'
  8.  
  9. frame = inspect.currentframe()      
  10. gpu_tracker = MemTracker(frame)      # 创建显存检测对象 
  11.  
  12. gpu_tracker.track()                  # 开始检测 
  13. cnn = models.vgg19(pretrained=True).to(device)  # 导入VGG19模型并且将数据转到显存中 
  14. gpu_tracker.track() 

然后可以发现程序运行过程中的显存变化(第一行是载入前的显存,最后一行是载入后的显存):

  1. At __main__ <module>: line 13                        Total Used Memory:472.2  Mb 
  2.  
  3. + | 1 * Size:(128, 64, 3, 3)      | Memory: 0.2949 M | <class 'torch.nn.parameter.Parameter'
  4. + | 1 * Size:(256, 128, 3, 3)     | Memory: 1.1796 M | <class 'torch.nn.parameter.Parameter'
  5. + | 1 * Size:(64, 64, 3, 3)       | Memory: 0.1474 M | <class 'torch.nn.parameter.Parameter'
  6. + | 2 * Size:(4096,)              | Memory: 0.0327 M | <class 'torch.nn.parameter.Parameter'
  7. + | 1 * Size:(512, 256, 3, 3)     | Memory: 4.7185 M | <class 'torch.nn.parameter.Parameter'
  8. + | 2 * Size:(128,)               | Memory: 0.0010 M | <class 'torch.nn.parameter.Parameter'
  9. + | 1 * Size:(1000, 4096)         | Memory: 16.384 M | <class 'torch.nn.parameter.Parameter'
  10. + | 6 * Size:(512,)               | Memory: 0.0122 M | <class 'torch.nn.parameter.Parameter'
  11. + | 1 * Size:(64, 3, 3, 3)        | Memory: 0.0069 M | <class 'torch.nn.parameter.Parameter'
  12. + | 1 * Size:(4096, 25088)        | Memory: 411.04 M | <class 'torch.nn.parameter.Parameter'
  13. + | 1 * Size:(4096, 4096)         | Memory: 67.108 M | <class 'torch.nn.parameter.Parameter'
  14. + | 5 * Size:(512, 512, 3, 3)     | Memory: 47.185 M | <class 'torch.nn.parameter.Parameter'
  15. + | 2 * Size:(64,)                | Memory: 0.0005 M | <class 'torch.nn.parameter.Parameter'
  16. + | 3 * Size:(256,)               | Memory: 0.0030 M | <class 'torch.nn.parameter.Parameter'
  17. + | 1 * Size:(128, 128, 3, 3)     | Memory: 0.5898 M | <class 'torch.nn.parameter.Parameter'
  18. + | 2 * Size:(256, 256, 3, 3)     | Memory: 4.7185 M | <class 'torch.nn.parameter.Parameter'
  19. + | 1 * Size:(1000,)              | Memory: 0.004 M | <class 'torch.nn.parameter.Parameter'
  20.  
  21. At __main__ <module>: line 15                        Total Used Memory:1387.5 Mb 

通过上面的报告,很容易发现一个问题。

首先我们知道VGG19所有层的权重大小加起来大约是548M(这个数值来源于Pytorch官方提供的VGG19权重文件大小),我们将上面报告打印的Tensor-Memory也都加起来算下来也差不多551.8Mb。但是,我们算了两次打印的显存实际占用中:1387.5 – 472.2 = 915.3 MB。

Pytorch在开始运行程序时需要额外的显存开销,这种额外的显存开销与我们实际使用的模型权重显存大小无关。 这个额外的显存Pytorch的开发者也对此进行说明了,这部分释放后的显存可以用,只不过不在Nvidia-smi中显示罢了,所以我们无需关注。

原文链接:https://www.toutiao.com/a7042862941057761830/

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