本文所用环境:
Python 3.6.5 |Anaconda custom (64-bit)|
引言
由于某些原因,需要用python读取二进制文件,这里主要用到struct包,而这个包里面的方法主要是unpack、pack、calcsize。详细介绍可以看:Python Struct 官方文档。这里主要讨论,python二进制转浮点数的操作。
python中一个float类型的数占4个字节。
二进制数据转float,可以用struct.unpack()来实现。
小文件读取
较小的文件,可以一次读取:
首先导入所需的包:
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import numpy as np import struct Python |
例如:我需要读取一个名为filename,存放着形状为[100,1025]的浮点数的文件。可以采用以下办法
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# 加载测试数据 f = open ( 'filename' , 'rb' ) # 102500为文档中包含的数字个数,而一个浮点数占4个字节 data_raw = struct.unpack( 'f' * 102500 ,f.read( 4 * 102500 )) f.close() verify_data = np.asarray(verify_data_raw).reshape( - 1 , 1025 ) |
大文件处理方法
我需要处理的文件大小有38.1G,存放着[10000000,1025]大小的向量。
关于大文件的处理,我参考了这文章,但是,这个方法不能很好的将二进制文件转换成浮点数。
所以我想到了另外一种办法:
通过Linux命令切割文件
通过split命令将38.1G的文件按照指定大小切割,
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split -b 820000k -a 2 filename data_ |
上述代码的意思是,指定每块大小为820000k,-a 2代表2位数命名,‘data_'代表前缀是'data_'
最终生成49个文件(字典序 aa – bw),前48个文件每个204800行 最后一个文件 169600行
通过python循环读取文件
首先构建词汇表:
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voc = [ 'a' , 'b' , 'c' , 'd' , 'e' , 'f' , 'g' , 'h' , 'i' , 'j' , 'k' , 'l' , 'm' , 'n' , 'o' , 'p' , 'q' , 'r' , 's' , 't' , 'u' , 'v' , 'w' , 'x' , 'y' , 'z' ] voc_short = [ 'a' , 'b' , 'c' , 'd' , 'e' , 'f' , 'g' , 'h' , 'i' , 'j' , 'k' , 'l' , 'm' , 'n' , 'o' , 'p' , 'q' , 'r' , 's' , 't' , 'u' , 'v' ] |
为了方便读取,将49个二进制文件转换成numpy专用二进制格式*.npy
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for i in voc: data_name = 'data_a' + str (i) f = open (data_name, 'rb' ) data_raw = struct.unpack( 'f' * 209920000 ,f.read( 4 * 209920000 )) f.close() data = np.asarray(data_raw).reshape( - 1 , 1025 ) np.save(data_name + '.npy' ,data) # 保存data_a*.npy文件 for i in voc_short: data_name = 'data_b' + str (i) f = open (data_name, 'rb' ) data_raw = struct.unpack( 'f' * 209920000 ,f.read( 4 * 209920000 )) f.close() data = np.asarray(data_raw).reshape( - 1 , 1025 ) np.save(data_name + '.npy' ,data) # 保存data_b*.npy文件 data_name = 'data_bw' f = open (data_name, 'rb' ) data_raw = struct.unpack( 'f' * 173840000 ,f.read( 4 * 173840000 )) np.save(data_name + '.npy' ,data_raw) # 保存data_bw.npy文件 |
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